琵琶湖の水生生物は食物連鎖でつながっています。その頂点は鳥や人（四次消費者）、次いで大型魚（三次消費者）、小型魚（二次消費者）、昆虫・貝・動物プランクトン（一次消費者）と続き、植物プランクトン・水草（生産者）が底辺となっています。

出典：大津市科学館－湖畔(こはん)の生態系(せいたいけい)

　植物プランクトンが増えるためには、最適な水温・塩分・光の量と「栄養塩」が必要です。

　「栄養塩」は窒素やリンなどを指し、自然界では枯葉や動物のフンから作られますが、人工的な家庭や工場の排水、農業肥料も栄養塩となります。

　栄養塩が琵琶湖に多く流れ込むと、植物プランクトンが大量増殖し「アオコ」「淡水赤潮」の発生原因になるそうです。反対に少なくても、食物連鎖に必要な植物プランクトンが足りず、生態系を崩す原因になります。栄養塩と琵琶湖の関係は、人間でいう食事と体調の関係に似ているそうです。

（出典：滋賀県－平成２９年度 琵琶湖における新たな水質管理のあり方懇話会「物質循環からみた琵琶湖の健全性評価手法について」資料２）

　琵琶湖環境科学研究センターが調査した琵琶湖全体の窒素やリンの年間分布状況は、滋賀県「琵琶湖水質の平面分布」（平成30年度）でまとめられており、8月・9月の南湖で窒素・リンが特に多くなっています。滋賀県「今日の琵琶湖」によるとアオコの発生も例年8月から9月末に発生しているようで、両者の関係性が見て取れます。

関連URL：

日本プランクトン学会－増殖生理

海の生態系を支える河川システム研究会「栄養塩」

環日本海海洋環境ウォッチ 環境省・NPEC/CEARAC－富栄養化とは